(1)應用中準確制備和定量投加粉狀活性炭的問題。為穩定粉狀活性炭吸附除污染的效果，應在一定范圍內盡量保證投加計量的準確，這不僅關系到處理效果，也與制水成本密切相關。根據合適的參數建造的整個粉狀活性炭儲存、配制、投加設備或系統需能很好地防止在各個環節造成的不穩定因素，如在輸送投加過程中的堵塞問題，會造成流量不穩定，從而影響除污染的效果。
(2)應用中粉塵飛揚的污染問題。在自來水廠應用中，由于粉狀活性炭在諸多環節如裝卸、拆包、配制、投加過程中勞動強度大、容易引起粉塵飛揚，造成工作環境惡劣，操作人員抵觸情緒較強，也成為制約粉狀活性炭技術應用的一個關鍵的、實質性的問題。
(3)粉狀活性炭技術的應用最為關鍵的問題是投資以及成本的控制，為滿足新的《生活飲用水衛生規范》(主要是CODMn<3mg/L，特殊情況下不超過5mg/L)，大多數水司均面臨技術改造的問題。對大多數水司而言，水質污染一般是間斷性或突發性的，常規工藝在大多數時間是能夠滿足新的規范要求的，因此粉狀活性炭技術是一項實用性非常強的技術，其投資相對較省，成本較低、投用靈活。
(4)設備或系統的自動化控制。為進一步降低粉狀活性炭投加設備的操作強度，如何實現自動化操作、與水廠原有自動化控制系統相配以及如何根據水質變化情況自動追蹤調整，以滿足穩定出水水質的目的，這也是制約該技術應用的關鍵因素。